此时，国民党已铁定要挑起全面内战，三人委员会已是一个摆设，整整三个月都没开过一次会。周恩来认为，时下最紧迫的是重启三人委员会，他向马歇尔建议召开三人委员会会议，讨论停战问题。当马歇尔向蒋介石反映周恩来的建议时，却遭到拒绝。于是，周恩来断然退出谈判，于9月16日离开南京来到上海。

马歇尔和司徒雷登急了，他们致函周恩来，一再催促他速回南京。在当时的情形下，国民党毫无停战的意向，周恩来就是回南京，也不会重开三人委员会会议。周恩来致函马歇尔：“我并非不欲回南京与阁下等共商停战之确切办法者，唯因政府当局不仅无停战表示，且变本加厉积极进攻张家口、哈尔滨、安东与苏北各地，若再冒昧商谈，徒骗人民，而为政府放手大打之烟幕，于真正和平决无补益。故宁留上海以待三人会议之召开。”

马歇尔收到信后，认为国共双方的焦点在张家口，于是多次找蒋介石，希望停止进攻张家口。这次，蒋介石倒给了马歇尔面子，回复对张家口的军事进攻停止十天，条件是，中共应按照他圈立的名额和要求，参加国民党所召开的所谓“国大”，中共的18个师，必须在限期内进入他所规定的区域。显然，这又是一个大的阴谋，耿直的马歇尔当然难以洞察其奸，反倒高兴起来，立即给周恩来送去备忘录，请速回南京。不多日，他又专程来到上海，再次劝说周恩来速回南京。周恩来考虑到马歇尔的诚意，应允即去南京。

就在周恩来即将前往南京时，10月11日，国民党军攻占张家口。蒋介石于当日宣布，11月12日召开“国大”。周恩来不得不取消南京之行。但是，很多民主人士出于对和平渴望，一再劝说周恩来去南京，正是在这种情况下，周恩来回到南京，并去见了蒋介石，没想到他只给予八分钟的接见，便拒而不谈实质问题而去了台湾。

蒋介石置周恩来的警告于不顾，如期召开由国民党一党支持的所谓“国大”，国共和谈的大门被重重地关闭了。周恩来走访马歇尔，告诉和谈破裂的真相，并表示中共代表团将择日返回延安。马歇尔显得特别沮丧：“我已没有理由再挽留你了。什么时候你回延安，我即时为你提供飞机。我也有义务保护中共在各地代表团人员安全，负责把他们送到你们那儿去。”11月19日，马歇尔亲自到机场给周恩来等送行，登机前，周恩来真诚地说：“让我们做个朋友吧，我们共产党人是不会忘记你的。”次年1月，马歇尔接受新的任命，担任美国国务卿，结束了劳而无功的美国总统特使的使命。