在弹道导弹防御，C4ISR和最新型的战斗机上的投资表现的尤为明显。在2006年12月，日本的立法机关通过了一项法律，将日本国防部转化为一个正式的政府部门，这对为满足新的挑战下的武器装备的采办方式产生重要影响。尽管国防部发生了变化，日本的军事预算却是连续第五年下降。将于4月1日生效的2007年预算总额为415.7亿美元，与2006相比减少了1.09亿美元。但是，用于导弹防御的预算却增加到15.4亿美元，与2006年相比增加了30.5%，即3.6亿美元。

由于来自美国的压力以及中国和北朝鲜的“威胁”，日本正在重组其海军部队，增强支持维和和人道主义救援任务的能力。重组计划包括在2006年宣布购买四艘排水量为5千吨的新型驱逐舰，来替代“初雪”级驱逐舰。该项目将投资7.17亿美元，计划到2015年完成。但是目前还没有选择承包商。海军计划缩减护卫舰编队数量，从原来的12个减少为8个，每个编队的舰艇数量从3艘增加到4艘。同时将成立两个独立的编队，即DDG编队和DDH编队。