毫无疑问，担负解放东南地区任务，并作为防止美国武装干涉的主要战略力量的第三野战军，在攻台作战上负有义不容辞的责任。粟裕自然成了指挥解放台湾战役的最佳人选。

1949年5月下旬，中央军委就责成华东野战军进行解放台湾的准备。华东野战军在追歼残敌、分兵剿匪的同时，抽出野战军主力第9兵团的4个军进行攻台的训练，同时担任上海地区警备任务。1949年6月14日，毛泽东为中央军委起草给粟裕、参谋长张震和副参谋长周骏鸣的电报，第一次明确提出攻台作战问题。这也是粟裕受命主持攻台作战准备工作的开端。

6月21日，毛泽东再电粟裕等人，指出：不占领台湾，则国民党海、空军基地不拔除，时时威胁上海及沿海各地；不占领台湾，则数十万吨船只不能通行，沿海沿江贸易受制于外商航业界。电报要求夏秋两季完成各项准备，冬季占领台湾。

毛泽东在给周恩来的信中又指出，建立空军，掩护渡海，“准备在明年夏季夺取台湾”。

在受命后的整整一年间，粟裕的主要精力是放在准备攻台作战和解放沿海岛屿，剪除台湾外翼上。为更好地完成攻台作战，粟裕经过反复考虑，于1950年6月建议由中央军委直接指挥或派大员指挥这一作战。

6月上旬，粟裕赴京参加中共中央七届三中全会。粟裕汇报了解放台湾的各项准备工作并请求由中央军委直接组织台湾战役。6月下旬，粟裕在给中央军委的报告中再次提出，由于台湾战役将对整个太平洋地区和东南亚局势影响较大，请求中央派刘伯承或林彪主持台湾战役，他本人作为华东地区的军事领导全力协助该战役的组织指挥。

鉴于粟裕在解放战争中显示出高超的指挥才能，毛泽东仍决定由粟裕负责指挥攻台作战。根据中央军委部署，攻台兵力中的空军、海军主要由中央军委负责建设和准备，陆军主要由第三野战军负责准备。

粟裕密切注视着敌我双方战略态势的变化以及国际形势的发展，着重研究现代战争中陆海空三军配合渡海作战的新战法，在调查研究的基础上，提出了一整套作战方案和战前准备措施。

随着东南各省的基本解放和对渡海作战艰巨性认识的不断加深，粟裕不断修正了攻台作战兵力投入方案。是年秋，根据毛泽东“以有力一部取台湾”的指示，第三野战军制定了以8个军攻台的作战计划，其中，以第9兵团4个军为攻台第一梯队，以另4个军为第二梯队。