信息时代的林奈

1858年7月1日，查尔斯·达尔文和阿尔弗雷德·华莱士关于生物进化的论文在伦敦林奈学会宣读。达尔文要表达的正是林奈所忽视的:分类学不仅是为了让生物找到自己的位置，还应该揭示生物之间的进化关系。揭示进化关系的生命家族树是达尔文次年出版的《物种起源》中唯一的插图。进化的历程中，一个物种分成两个，并没有分崩离析的神奇一刻。这是林奈时代时常鱼目混珠的原因。只是10个物种，也会有超过3400万个可能的进化树。

如今，交流发现的需要已经使传统的发布手段力不从心。全球每年出现的约2.5万个新物种名字发表在数千种刊物上，很多不为人所知。虽然出现了ZooBank和MycoBank等电子数据库，仍没有一个术语规则认可单纯在电子媒体上发表的新名字。

过去30年，基因测序使生物分类再次发生革命。仅几个主要的测序中心每秒就能完成5000对DNA的测序，现在已完成约1000个物种的基因组测序。基因测序确定了我们最近的亲戚是黑猩猩而不是大猩猩。这是林奈的知识完全无法理解的，但基因组研究也不可忽视进化研究。2001年，人类基因工程组宣布有100至200个人类基因直接来自细菌，因为在人和细菌中都发现了这样的基因，但没有在任何更接近人的物种身上发现。有人推测它可能是通过从细菌的横向基因转移进入人体的。马里兰州基因研究院的乔纳森·埃森看到这个消息时说，“我感到有点反胃，他们说与大脑发展有关的基因直接来自细菌。我想了一分钟，还是觉得没道理”。他和另一个同样目瞪口呆的进化生物学家迅速打破了这个说法，他们表明:这些基因更可能是存在于人类和细菌共同的祖先体内，只是后来隐藏起来。

对生物多样性了解越多，越需要分类。对一个专门的分子生物学家，苍蝇指的是黑腹果蝇就很满足，对群落生态学家就必须识别数百个种。2007年4月8日，约3000名生物学家联合开展的生物物种名录编纂经过6年努力，物种突破百万大关，达到100.9万。预计2011年编纂完成时，名册将囊括175万现存物种。利用加拿大生物学家保罗·赫伯特提出的生命条形码方法，今后外行或许也可以通过小型的DNA条码来识别复杂的物种。

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