钱三强此话一出，引起了很大的震动。散会以后，原子能研究所的一位党支部书记、副所长李寿南就直接找钱三强提意见：“你怎么能够这样说，你叫支部书记今后还怎样去进行工作？”

钱三强冷静思考以后，主动向李寿南认错：“我的讲话，有片面性。”

很快，毛泽东批评了周恩来的讲话，说知识分子仍然是资产阶级的，仍然要脱胎换骨，说全党开展反右倾。全国的政治形势急转直下，周恩来做了检讨，钱三强当然也要检讨。

但钱三强的检讨并没有得到宽容，由于他是在大会上公开讲这类话的，这比反右派运动时的错误还要严重。有人认为，钱三强是更加露骨地反对党的领导，认为他不能留在二机部领导岗位。此外，还有一条理由：钱三强在国外有不同寻常的关系，不利于做好保密工作，他不能再参加原子科学的攻关活动。

经过十多年的呕心沥血、艰苦奋斗，各部门已经大体上做好了准备，国防工业办公室向党中央写出了《关于自力更生建设原子能工业情况的报告》，计划在1964年把第一颗原子弹试爆成功。在这样的时刻，把钱三强调出去，已经不会太大地影响这项工程的进度了。

事情闹到这一步，周恩来派人来了解情况，二机部副部长、党委副书记刘伟同志就说：“调走三强同志这个报告是谁搞的？我为什么不知道？这种行动符合党的原则吗？对一位对党忠诚的同志，能够这样随便怀疑吗？”

1978年秋，我去全国人大办公厅拜访刘伟同志时，他仍在愤愤然为钱三强鸣不平：“这样一位对党忠诚的科学家，是我们的国宝，为什么要怀疑、打击？党内有一股不正的风气呀！”

为了弄清问题，周恩来亲自到二机部听了一天情况汇报，因为有外事活动，又派聂荣臻副总理来继续听汇报。摸清情况以后，聂荣臻元帅代表周恩来总理宣布说：“你们连钱三强也不相信，你们还能相信谁？”

周恩来批评了二机部的有关领导人（当然也批评了钱三强对党的领导不够尊重的言行），调出钱三强的计划也就没实施。谈到这段经历，钱三强对周恩来、聂荣臻是充满感激的。