但冈村宁次并没有理睬蒋介石的话。日本的中国派遣军中专门从事秘密谈判的今井武夫也以缪斌品质低下为由反对与缪斌接触。外务省则以汪精卫政权已得到“国际承认”为借口，反对缪斌所带来的取消汪精卫政权的提案。日本陆军、海军和外相都怀疑缪斌是否与重庆方面有联系，指责缪斌没有委任状，怀疑他是个江湖骗子或掮客。他们还认为，联合国军队方面将取得胜利，蒋介石没有理由与日本进行和谈。重光葵外相正在全力以赴请苏联出面议和，对其他的渠道不予重视。

日本最高战争指导会议3月21日召开，主题便是讨论缪斌带来的方案。重光葵公开声称，首相撇开外相直接从事外交活动侵犯了外相的权力，因此首相如果违背他的意见一意孤行的话，那倒阁也在所不惜。会议没有结论，四十分钟就散会了。小矶国昭无奈单独向裕仁天皇上奏，天皇表示反对。第二天天皇下令尽早将缪斌遣返回中国。

失去了保护神

缪斌在日本躲藏逗留一段时间后回上海，1945年5月25日，他收到重庆方面“停止关于所谓和平撤兵谈判”的电报，缪斌的活动就此告终。1946年3月17日，在蒋介石与缪斌之间承担中介的戴笠因飞机失事坠死，缪斌失去了强有力的保护人。

此时，美国驻日本占领军在接收日本战时内阁档案时，发现了日本内阁讨论缪斌活动的档案及《缪斌与东久迩宫和平会谈的记录》。东京审判时，日本方面举出的辩护资料《木户日记》中也有缪斌工作的记录，此事立即引起各方面的关注。

在盟国的对日理事会上，苏联指责中国政府联络美国派遣缪斌到日本，策划对日妥协。而当时国共两党已经处于内战一触即发的紧急状态，中共也批评蒋介石利用缪斌策划投降。麦克阿瑟遂电询蒋介石为什么瞒着美国与日本单独媾和。还准备传缪斌去东京做证人。蒋介石复电表示绝无此事，并立即下令逮捕了缪斌。

第一个被处死的汉奸

针对缪斌的审判1946年4月3日开庭，检察官宣读起诉书，列举缪斌勾结日本侵略者、通敌谋反、为害本国、担任日军特工和伪府要职达八年之久等一系列罪行。当讯问他叛国的罪行时，缪斌取出准备好的材料，为自己辩护说：“蒋委员长曾说过，抗战有种种途径，除战场外，策反也是重要的工作。本人虽然出任伪职，但身在曹营心在汉，曾与中央军统局暗通消息，为了救国搞软性抗战，做策反工作，谋求以敌制敌，促进敌人自己溃散。”

缪斌一边出示有关电报等证件，一边口称“敬之兄”，述说与何应钦等书信来往的密情。但检察官一再声明不要他陈述这些事，只要他供述在日伪政府任职期间犯下的罪行。但缪斌仍然按自己的思路说。最后不得不匆匆终止审讯，宣布8日下午2时判决。 4月8日审判长问过他的姓名、年龄等之后，当庭宣判：“被告缪斌通谋敌国，图谋反抗本国，处死刑，褫夺公权终身。”