归并詹事府于翰林院，裁通政司、太常寺、光禄寺、鸿胪寺、太仆寺、练兵处等，分别归并于礼部和陆军部。1904—1905年，还裁撤了云南、湖北、广东三省巡抚(《光绪朝东华录》，第5257页。)，裁撤东河总督及广东海关、淮安关和江南织造衙门、福建水师提督等闲衙。在整顿吏治上，戊戌时就提到了这一问题；在清末，限制卖捐实官。1901年曾宣布:“嗣后无论何项事例，均著不准报捐实官”(《光绪朝东华录》，总（四）第4718页。)。还处分了一些腐败的地方官。例如:1903年，命“年力就衰”对其子管教不严的四川布政使陈璚，“以原品休致”，其子道员陈大浩“贪利招摇、干预公事，著即行革职”(《清德宗景皇帝实录》，卷521第14页。)。两次新政，不忘加强专制统治:戊戌时曾规定，要实力举办保甲及筹办团练；在清末则编练巡警，推行警政，此事先出自于直隶，后波及各省，1905年，设立巡警部。此外，还改变了对旗人的供养制。戊戌时，提到了这一问题；而清末则宣布:让旗人“各自食其力”(《清德宗景皇帝实录》，卷505第2页。)，“劝谕旗兵妇女学习蚕桑，以裨生机”(《清德宗景皇帝实录》，卷578第4页。)。注意增加些民主气息。戊戌时允许大小臣民上书言事及自由办报、办学会等。清末则注意改革刑罚制度，废止苛刑，规定“凡死罪至斩决而止，凌迟及枭首、戮尸三项，著即永远删除。”“刺字等项，亦著概行革除”(《光绪朝东华录》，总（五）第5328页。)。并命令停止刑讯，改刑罚为罚款，或“折为作工”等等(《光绪朝东华录》，总（五）第5329页。)。

加强军队建设，也是两次新政的重要内容之一。戊戌变法时就规定:“裁减绿营”，清军改用洋枪、洋操，采用西洋兵制，筹款添造兵轮战船，扩充海军实力，增加水师学堂学生名额，培养海军人才。清末新政时，先于1901年8月，宣布废除了武科科举考试制度(《光绪朝东华录》，总（四）第4697页。)。并且命令“于各直省会建立武备学堂，以期培养将才，练成劲旅”(《光绪朝东华录》，第4718页。)。同时，注意裁减旧军，编练新军。如1901年，清朝命令，“所有各省原有之绿营防勇，均限于本年内裁去十之二、三，及上年有事时添募之勇营，亦一并酌量裁撤。”(《光绪朝东华录》，第4695页。)“精选若干营，分为常备、续备、巡警等军，一律操习新式枪炮，认真训练，以成劲旅。”(《光绪朝东华录》，第4718—4719页。)1903年公布了奏定《新军营制饷章》，1907年，又拟定全国共计编练新军三十六镇。到辛亥革命爆发前，全国共编成了十六镇。此外，也注意了海军的建设，张之洞主张废旧船，造新船，同时还派遣人员学习海军，整顿水师。

两次新政，对文化教育给予了特殊的重视，其主要包括改革科举制度，设立新式学堂及派遣留学生等项。首先，改革和废除科举制度。戊戌变法时，曾命令自下科开始，会试、乡试及生童岁科，旧用四书文者，一律改试策论。后来又规定乡会试仍为三场，一场试历史政治，二场试时务，三场试四书五经，又要求开经济特科以选拔人才。清末新政时，先是改革科举制度，1901年，宣布取消“八股文程式”(《光绪朝东华录》，总（五）第4992页。)。1903年，张之洞等提出了逐渐废除科举制度的主张，1905年，再次上折请求废除科举以利于兴办新式学堂。清政府采纳了张之洞等人的建议，决定“自丙午（1906年）科为始，所有乡会试一律停止，各省岁科考试，亦即停止。”(《光绪朝东华录》，总（五）第5392页。)清末，还举办了经济特科。其次，设立新式学堂，传播西学。戊戌变法时，曾要求各地广设新式学堂，提倡西学。1898年8月，在北京设立了京师大学堂，并且规定各省多设中、小学堂及各种专科学堂。清末新政时，更重视人才，认为:“为政之要，首在人才，”(《清德宗景皇帝实录》，卷483第13页。)。因此大力兴办各类学校。1901年，要求将“各省所有书院，于省城均改设大学堂，各府及直隶州均改设中学堂，各州县均改设小学堂，并多设蒙养学堂。”(《光绪朝东华录》，总（四）第4719页。)1904年，张之洞等人制订的《奏定学堂章程》颁布了，促进了办学。同时，清朝还特别重视师范学堂的建立，指出:“开通国民知识，普施教育，以小学堂为最要。则是初级师范学堂，造就教小学师范生，尤为办学入手第一义。”(《奏定学堂章程》，光绪三十年铅印本。)当时，中国出现了办学热潮。在北京，加强了对京师大学堂的管理、整顿，并拓地兴建校舍，扩大了学校规模。在全国，各级各类学校大量涌现。第三，派遣留学生出洋学习。戊戌时，光绪皇帝曾发布谕令，要求各省选派生员出国留学、游历等。而清末，中国派遣留学生出洋达到高潮，清朝政府命令各省选派“心术端正、文理明通”(《清德宗景皇帝实录》，卷492第10页。)之士，以官费资送出国学习，也注意选派宗室、八旗子弟出洋留学，同时，还鼓励自费到各国留学，后来，又号召赴欧美留学。在清朝政府的号召与各省的努力下，在青年学生的斗争及其家庭的大力支持下，官费、自费留学生逐年猛增。

从戊戌变法和清末新政的主要内容相比较，我们可以看出:这两次新政不论在经济方面、政治方面、军事方面，还是在文化教育方面，所推行的政策，基本上都是相同或相类似的。因此，我们可以这样说:西太后是把被自己推翻了的戊戌变法，又拿来重演，在继续完成她的“敌人们”所没有完成的变法维新事业。