分手时，文强说，你这个共产党员过得也很困难，就送他100块钱。后来，皖南事变，袁国平被自己的警卫员一枪打死了。

淞沪抗战失败后，文强收容了隶属军统的一千来人的队伍往西撤，当撤到一个小县城时，正好遇到一批战场撤下来的伤兵在县城里为非做歹。文强一时好事，就想管管，就命令手下的参谋去找了一些白布，挂在县城的一个最高的建筑——澡堂门口，文强在上面写了几个字——县警备司令部。当时他手里有一套少将官服，就穿上冒充警备司令维护起了秩序（按国民政府的规定，警备司令有权枪毙人），命令手下抓了几个带头闹事的伤兵，先威胁要枪毙他们，接着又罚他们干苦力，其它人全轰出了县城。搞了几天，县城是平静了，但文强假冒少将的事却被人告发，官司一直告到了顾祝同那里。文强也直接打电报给顾祝同解释，顾祝同认为在当时兵败如山倒的情况下，文强还有精力管这种事，很有能力，当即给文强回电说:“你这个警备司令部在我这里备案了，现正式委任你为少将。”

撤退到重庆后，戴笠让文强担任国民政府军事委员会驻上海策反委员会主任委员和忠义救国军上海办事处处长，具体的任务有两个:一是对付日本人和汪精卫，一是代表戴笠驻上海，主要搞情报工作，于是文强又回到了上海。

文强在上海主要通过国民党在青红帮里的关系，发展伪军中的内线，并策反高级军官。从其自述来看，并没有取得太大的成绩，反而自己的网络不断被日军破坏，到最后连自己的据点都被日本人端了，不得不在珍珠港事变前撤退到了香港，在香港时又遇上太平洋战争爆发，很狼狈的经澳门跑回了重庆。文强在从上海撤退前给戴笠的电报中，说了一通自己现在多危险，情况多恶劣，最后又说自己要不畏艰险，为国尽忠。当时军统许多特务投降日本，正是戴笠很难堪的时候，忽然接到这封电报着实是感动的够呛，还特意拿给了蒋介石看，来说明军统还是有忠心的人的。为此文强回到重庆后，还受到了蒋的接见。

回到重庆后，戴笠又安排文强去太行山，有两个任务，一是听说孙殿英要降日，要控制住他。第二是原华北军统网络被日军破坏，要重建网络。当时文强什么都没说，就答应了，为此戴笠很高兴，把自己的左轮手枪送给了文强。文强事后回忆到:”我刚从上海、香港、澳门死里逃生回来，又要到那么复杂的环境里去，我还能说什么呢？”

文强以军事委员会高参的名义先到了西安同胡宗南联系上，又转到洛阳见到了蒋鼎文。由蒋鼎文安排进入了太行山区。

文强到了孙殿英处才发现形势复杂。山上的国民党三个主力军队，庞炳勋的四十军，胡宗南手下刘进的二十七军，孙殿英的新五军，这三个军队，互相不和，你不听我的，我也不听你的，谁都不服谁。而且庞和孙都分别在同日本人暗地里联系，文强试图在中间调和，但没什么效果。

不久，日军扫荡，孙殿英公开降日。有意思的是庞炳勋当时躲在山洞里，谁都找不到，孙殿英知道庞的烟瘾很大，就命令人在附近的大烟馆守着。果然，不到一个星期，庞炳勋的烟瘾犯了，实在熬不过去，派副官化装成老百姓下山到镇上买烟土，被孙殿英抓个正着。审问出庞炳勋藏身的山洞，孙殿英亲自把烟土带到庞的山洞口，开始庞守在山洞里死活不出来，还说守不住就自杀，绝不投降小鬼子。孙命人在山洞口把大烟点起来，庞炳勋在山洞里闻着烟土味实在受不了了，破口大骂孙殿英坏了他庞炳勋的一世英名，然后出洞投降。

孙殿英本想拉着文强一块投降，文强不同意，带着军统一百多人跑了出去，孙也没有强行阻拦，事后还做保，把被日军俘虏的一批军统和中统人员放了出去。为此许多军统和中统的人都说孙的好话，以至最后孙降日不但没受到处罚，还得到了重庆方面的嘉慰。

文强跑回洛阳后，改任河南中美合作训练班第三班副主任。日军发动打通大陆交通线战役时，文强带着训练班的人负责炸毁国民党撤退路线上的所有桥梁，并在主要路段上埋雷，阻挡日军进攻。由于干的不错，有效的掩护了司令部的撤退，并且训练班二千多人无一人伤亡，被提升为军统北方处处长，调到西安，负责晋、陕、豫、冀、察、鲁六个省和平津两个市的军统工作。

日本宣布投降后，文强跟着胡宗南到郑州参加受降。参加受降后，第八战区司令长官胡宗南和第十一战区司令长官孙连仲两个人打电报给蒋介石，说文强抗日功劳很大，应该晋升中将。1946年，蒋介石正式批准升为中将，这一年，文强39岁。

内战开始后，戴笠让文强接手东北，任军统局东北办事处处长，对外的身份是东北行营督察处处长，负责建立东北的军统情报网并督察东北的军政人员。

在东北的这段时间，文强认识了杜聿明，并和杜处的很好。杜认为文强很有能力，又不像其它军统人员那样经常往上打小报告，很喜欢和其共事，不过这个好印象事后害了文强。

1946年3月，戴笠坐的飞机失事，戴笠死后，军统局内就分为三派，相互争得厉害，郑介民，是黄埔第二期的，他是十三太保里的人，第二个是戴笠的主任秘书毛人凤，也是个黄埔学生，第三个是唐纵，他是黄埔第六期的，也是十三太保之一，他们都要当局长。

文强并没有当局长的实力，但他一直在地方干，同许多地方诸侯都很熟，在东北和华北也有一定的势力，成为三家争夺的对象。而文强一时又看不出那派能获胜，知道接近哪一派，如果站错队都会有杀身之祸，而原有的后台戴笠又死了，于是决定退出军统，但是不能明退，就又找到了父亲的朋友程潜，说愿意来到程潜手下帮忙。程潜当时刚刚当上长沙绥靖公署主任，管湖南和江西两个省，还兼湖南的主席。正要在绥靖公署成立三个兵团，最是需要人的时候，就让文强过来当他的办公厅主任，并给军统的三巨头各写了一封信，说很需要人，要把你们那里的文中将借来用用。程潜是元老，级别很高，军统也没办法拒绝，但只同意是借调，同时还给文强保留了个设计委员会的中将委员的职务，方便他能随时回来，临走时毛人凤还请文强吃了顿饭。

文强只在程潜那里呆了一个多月的时间，就收到了蒋介石的电报，说杜聿明担任了徐州剿总副总司令，指名让文强担任其副参谋长，负责人事，司法和后勤。程潜本不想让文强去，但文强想，他是蒋介石的学生，又有正式的调令，身为军人，不得不服从命令。另外杜单独给他发了个电报，说原参谋长舒适存是原中共的人，南京和他这边都信不过，去了后实际由文强负责，享受参谋长的待遇。文强想想一下可以统管十六军，算是高升了，也很想去。