不过，这些新立的政党或半政党组织彼此间分分合合，此消彼长，数月一变或者一月数变，成员甚至领袖也毫不固定，今日是此党，明日却成彼党，令当时的人为之目眩，也令后来的研究者为之头疼。

譬如后来在临时参议院中一时雄起的共和党，便是由统一党、民社、国民协进会、国民公会和上文提到的国民党五个组织合并而来。说到统一党，原本是章太炎发起的，但由于他这个人脾气极大，一向孤傲难以合群，弄到最后党内很多人也不能容他，结果开党元勋章太炎反被排挤了出去，最后袁世凯的亲信王赓（即后来的大汉奸王揖唐）控制了统一党，章太炎反由一个组党的急先锋变成了一个无党分子，闹腾一场不过是为他人做嫁衣裳（看来文人和政客也是术业有专攻，非专业人士不能从事）。

共和党是1912年5月9日在上海张园正式成立的，副总统黎元洪被选为理事长，张謇、章太炎、伍廷芳、那彦图为理事，另外还选出干事54人，包括当时的知名人物熊希龄、范源濂、章宗元、蒋尊簋、朱瑞、庄蕴宽、吕公望、赵惟熙、杨增新、胡景伊、程德全等人，都加入了共和党的圈子。共和党大多由清末的立宪党人及旧官僚所组成，他们的政治取向是维护统一共和、支持中央集权主义，正好与袁世凯的想法不谋而合，因而被袁世凯利用来对抗同盟会。当然，共和党也有自己的想法，他们虽然用国权主义抵制同盟会的民权主义，并在参议院中与同盟会的革命党人作对，但其实也是想借助袁世凯的支持来发展自己的势力，以待日后能够独立执政或者与袁世凯分享权力。共和党成立后，便在全国各地积极设立分部，其党员数量一度超过了10万人。

在全国各地组党运动如火如荼的形势下，同盟会也感到了莫大的压力。在开始的是时候，同盟会于3月3日在南京三牌楼召开本部全体大会，宣布同盟会正式改组为公开的政党。在组织上对外公开后，同盟会挟革命之盛誉，在各地都得到了迅速发展，会员在数月间便增至十数万人，支部也遍于18行省，成为民国初年势力最大的一个政党。

迁到北京的临时参议院在经改选后，共和党因为合并党派而势力大增，同盟会在人数上已经不占参议院的绝对多数，而共和党更是借助袁世凯的势力，在很多事务上压同盟会一头。在这种情况下，宋教仁向孙中山、黄兴提出改组同盟会，并打算像共和党一样，将其他政治主张接近的党派合并而入。孙中山和黄兴在辞去公职后，在政治一度消极，对宋教仁的主张既不反对，但也不是十分热心，因而让宋教仁得以施展手脚，对同盟会进行一次大规模的组织更新。

除了同盟会和共和党外，当时在参议院中占据一定议席的是号称“第三党”的统一共和党。这个党派也是由三个政团合并而来，其中的主要人物包括蔡锷、景耀月、彭允彝和谷钟秀、吴景濂等人。统一共和党在内阁风潮中也受到共和党与袁世凯势力的排挤，因而和同盟会走得比较近，最后双方都产生了合并的想法，增强彼此竞争力，以便在即将到来的正式国会选举中获得优势。

但在改组合并问题上，统一共和党人并不想直接并入同盟会，而是提出三点要求:一是变更同盟会名义，二是废除民生主义，三是改良内部组织。事实上，统一共和党人并不希望自己是被吞并，因而主张不用同盟会原来的名号；而且，他们也不赞成同盟会过于激烈的主张，譬如民生主义中的平均地权等。

在同盟会这边，当时最积极的是宋教仁、胡瑛、魏宸组、谭人凤、刘揆一等人，但也遭到了很多同盟会员的抵制，因为他们认为目前局势不稳，很容易被人乘虚而入并加以瓦解，而一些同盟会员对改变沿用了多年的同盟会名号也表示坚决反对，如蔡元培就表示“不能舍己从人，名称万不能改”。

这时，清末名臣岑春煊为首的上海国民公党在得知统一共和党和同盟会要合并的消息后，也派出代表到京参与合并谈判，但他们除了同意统一共和党所提出的三个条件外，又提出一条要求，那就是将同盟会纲领中的“男女平权”一项取消。

经过商议后，同盟会接受了统一共和党和国民公党所提出的条件。 8月7日，北京的共和实进会和国民共进会也派代表参加合并谈判。8月13日，这五党发布联名宣言，宣布新的国民党成立。由此，同盟会的名称便退出历史舞台，正式改组并更名为国民党。