据台湾《联合报》报道，按民进党现行“纪律评议裁决条例”第三十三条之一的规定，民进党政务官不得担任派系职务，或是参加派系运作，违者应予除名或停权一年以上之处分。去年“全代会”通过解散派系后，等同党公职人员都不能有派系活动，党中央有人建议将这项处分规定扩及县市长、“立委”等党公职人员。

对于党中央的作法，党内骂声连连。民进党“立法院”党团书记长王拓说，“全代会”去年就解散派系了，不知道党中央在作什么，这么做只是“与风作战”。

谢系、新潮流系被视为解散派系最大目标，“立委”江昭仪认为，谢长廷有什么事，“立委”出来开记者会，这样也算是派系吗？如果其他“立委”一起站出来壮大声势，也会被列入“谢系”而遭处分吗？政治就是人的事，不太可能都没有人际交流。

有“立委”指出，过去解散派系有明确定义，比方不能有办公室等，但现在谢系、苏系以精神领袖为中心，算不算派系？还有“立委”质疑，以前要解散派系，应该是冲着新潮流，现在党内当红、最有组织的应该算是“谢系”，此时谈扩大解散派系，该不会是为了“打击谢系、鞭尸新系”？

新系“立委”蔡其昌用民进党“三宝”为例，“三宝”林重谟、蔡启芳、侯水盛经常一起开记者会，算不算派系？如果“派系”没有说清楚，党籍“立委”问政会增加许多困扰，党内也会留下斗争的伏笔。

民进党去年“全代会”通过解散派系条款，各派系看似解散，但是经过这次党内初选的激裂竞争，派系间裂痕更加恶化，派系问题并未解决。加上先前“全代会”决议要求党中央必须在下次“全代会”提出解散派系的配套方案，而6月30日“临时全代会”召开在即，使得民进党内的派系问题搬上台面。