袁世凯死后，副总统黎元洪继任大总统职，为了平息与西南方面的纷争，段祺瑞同意恢复《临时约法》召集国会，于是南北融合，气象一新。

可是，国内和平刚一实现，黎、段之间的矛盾马上继之而来。段祺瑞依然是段祺瑞，而黎元洪不是袁世凯，段祺瑞根本不把他放在眼里，不仅段祺瑞骄横，连徐树铮及手下人对黎元洪也十分无礼。

一次，国务院任命了几位外省的厅长，徐树铮拿着委任令去总统府盖印。黎元洪见名单上的几个人名字很陌生，便随口问了一下。徐树铮便不耐烦了，用训斥的口气说道:“你问那么多干什么？让你盖印你只管在最后一页盖就是了。我还忙得很，哪有闲功夫？”黎元洪气得脸色发白。

黎元洪忍气吞声，但是，他的幕僚却愤愤不平，于是和国会中反段力量联合起来了。国会中“韬园派”反段最为激烈，其首脑是段祺瑞最讨厌的孙洪伊。孙洪伊进京后，与黎元洪商议提出联直排皖、联冯排段的计划。

面对总统与总理的冲突，总统府秘书长张国淦两面为难，于是干脆辞职撒手不干。接替他的是总统府方面强硬的代表丁世峄。丁一上任便提出要划分府院权限。这一提议仿佛在热锅上洒了盐。段祺瑞气得一拍桌子道:“好吧！我不干了，让黎黄陂一个人干吧！”

段祺瑞甩手不管，黎元洪又害怕了，赶紧找人向段表白，同时也向他诉苦，反映国务院某些人目无总统。段祺瑞也不想把事情闹大，于是趁机重新视事，同时对部下作了一些约束。

一波未平，一波又起，国务院内狼烟四起，闹事的是内务总长孙洪伊。

事情起因很多，主要源起于一件事。国务院任命郭宗熙为吉林省长和查办福建省长胡瑞霖案。因为国务总理发布的命令还须经分管的总长副署方可生效。而徐树铮为了免得孙洪伊从中作梗，直接越过了孙洪伊。孙洪伊自然得理不让人，要求查办徐树铮。段祺瑞则想把大事化小，孙洪伊一气之下便递辞呈。后来虽然未辞成，却埋下了祸因。

徐树铮受了孙洪伊的气，发誓要进行报复。机会来了，孙洪伊换了袁世凯时代的内务部旧职员30余名。这些人或多或少与北洋高级官员有联系，事情捅到了段祺瑞那里。

有了总理的支持，被解职的人员便向政府仲裁机构平政院提出诉讼。平政院也明白有总理在背后撑腰，便判决原告胜诉，要内务部限期撤销解职令。孙洪伊当然不干，声称平政院是袁世凯私立机构，其判决不足为据。

事情弄到这个份上，段祺瑞不能不说话了。他要孙洪伊接受裁决，孙洪伊索性横下心来，坚决不同意。段祺瑞气得火冒三丈，说“你结党营私，滥用私人！平政院的判决我看很合理，难道就没有人管得了你了？”

孙洪伊索性撕下了脸，大叫道:“我撤除的是帝制余孽，官厅不能成为庇护他们的场所。”

段祺瑞决心除去孙洪伊，于是签署了罢免令。黎元洪大吃一惊，压下了这道命令。徐树铮催促了四次，都无结果。

段祺瑞被激怒了，于是亲自出马见黎元洪，气冲冲地问:“孙洪伊的罢免令已经送来好几天了，大总统不会不知道吧？”

黎元洪支支吾吾着，说应当慎重考虑这件事，段祺瑞火冒三丈，说:“照你这么说，我是不慎重了？”

“这个，唔，这个……”

“那好，大总统既不免他的职，就请免我的职吧！”