赵少康：李登辉特别提到，我看前两天在报上他说以后两岸应该是政府对政府，在WTO的架构下来协商，不需要经过海基会，海协会，你怎么看这个事情？

马英九：这个跟我们的规划是不一样的，因为海基会、海协会也是在李登辉执政的时候，我们陆委会所设计出来的，也是我个人在担任陆委会副主委之前设计出来的，包括陆委会的成立是采取委员会，而不是采取大陆事务部，同样的，关于海基会成立，也需要对方有一个对口机关，这都是我过去规划的，我觉得到这个阶段，还没有让这两会停止运作的条件，还是要靠他们两个来运作。

赵少康：就是海基会现在还会是政府的白手套。

马英九：对。因为什么道理呢？因为海峡两岸目前的情况跟过去的，譬如说过去的前40年，那个时候双方相互否定的。可是等到我们废除临时条款，我们已经不再采取原来的立场了，可是我们也不可能承认他，我们的“宪法”不可能容许，在我们的“国土”上有另外一个政府存在，它也同样的有这个问题，所以双方不可能从相互否认跳到相互承认。

赵少康：互相不否认。

马英九：所以我现在最好的办法是相互不否认，那相互不否认的话就是说，譬如说，你说你是中华人民共和国，我说我知道了，我说我是”中华民国“，你说我也知道这回事，就好了，换句话说，并不需要你双方相互承认，因此双方如果政府对政府的话，很可能碰到这样的问题，所以透过一个海基会能够做一个白手套，那么政府想要参与的话，可以以海基会顾问的身份来参与，我觉得这种方式对双方最方便。