主要施政主张：

争取2008年国民党重新夺取执政权。

坚持“九二共识、反对台独”，以“连胡会”愿景为基础推动两岸关系。

依法处理党产，和“黑金”划清界限。

积极推动泛蓝整合。

保钓运动的理论研究者

马英九不但是“保钓”的行动派，而且更是“保钓”的理论研究者。他在美国哈佛大学修读博士学位时的博士论文《怒海油争：东海海床划界及外人投资之法律问题》，就是台湾地区首部研究钓鱼台问题的学术论着。马英九返台并在政治大学法律研究所教书时，又在这篇英文论文的基础上，再对钓鱼台问题深入研究，于1986年1月以中文写成《从新海洋法论钓鱼台列屿与东海划界问题》一书。

蒋经国眼中“没缺陷”

马英九在蒋经国身边一呆就是7年，前两任分别是钱复和宋楚瑜。7年间，他深得蒋经国的喜欢，被称赞为“没有缺陷的年轻人”，经常以“英九”直呼其名，对其关心的程度“像对亲子一样”。1984年6月，蒋经国力排众议，破格提拔马英九任“国民党中央副秘书长”，负责推动“政党外交”。在国民党论资排辈的传统体制中，马英九以34岁即跃居要职，超越钱复、宋楚瑜等人。

严于律己的“不沾锅”

在台湾娱乐化的政治生态下，马英九从未传出过任何花边新闻。他自己曾为此下过注解：“美女坐怀我还是会乱，所以唯一能做的，是不给任何美女有坐怀的机会。”

所以，大学任教期间，凡是女学生到研究室找他，他必然洞开门窗；从政后，凡有女FANS请他在衣服上签名，他一定会悬腕。

在媒体眼里，马英九似乎永远是“温良恭俭让”，一派谦谦君子形象，甚至已经引不起无孔不入的“狗仔队”任何兴趣。因为很难从生活作风上找到什么缺点，政敌们只能用“不沾锅”来给他扣帽子。