得知黄俊英落选，国民党主席马英九神情落寞。中央社

国民党在民进党弊案缠身情况下，仍未能拿下高雄。岛内学者分析，党主席马英九将饱受党内严厉的批判、检讨，加上立法院长王金平近来动作频频，昨日投票前还与陈水扁、吕秀莲会面，故马英九党内地位备受挑战。台湾中山大学政治研究所教授廖达琪就提出，马英九08年大选之路将陷苦战。但也有专家指出，由于亲民党宋楚瑜退出政坛，势将推动国亲两党整合，将为08大选“聚拢”泛蓝选票。

国民党在民进党弊案缠身情况下，仍未能拿下高雄，岛内政治评论员普遍认为马英九的08“总统之途”已平添更大变数。国民党人士不讳言，选后“国民党内的风暴不亚于民进党”，据了解，民进党主席游锡控告国民党贩卖党产，就是国民党内部的人爆的料，马英九未来面对的困境，恐怕还会再继续扩大。

著名政治评论员胡忠信指出，其实不管是2002年高雄市长选举，还是2004年“总统”大选，高雄的基本盘还是绿大于蓝。这次的两市选举结果仍然是国民党与民进党对峙，从政党政治结构来说，仍然是一种平衡。这个结果对陈水扁而言，只是维持现状，损失不大。但对于马英九来说，就是一个挑战，因为本来在对民进党揭弊的有利情况下，黄俊英应该赢5万票左右，但现在反而以1,120票败选，这对马英九的领导力是个大挑战，也意味着他的08大选之路并不会如预想的那么顺利，因此国民党需要深刻检讨。