中华日报发表评论文章称，马英九日前表示，大陆游客来台人数越来越多，是不是考虑在某些项目上，双方互设机构？这虽然不是新话题，但出自马英九之口，显示时机日趋成熟，相信在可预见的未来，两岸互设机构一定可以实现。

两岸互设机构的构想，民进党时期即已有之，前年七月，时任海基会董事长的洪奇昌接受媒体专访时，曾表示:“希望海基会能够到北京、上海、广州等地设置办事处。”但当时两岸关系紧绷，大陆方面完全不予理会。去年六月陈江首会时，海协会长陈云林表示大陆民众申办赴台旅行证，要透过香港发放，非常不便，希望在香港办理两岸签证的中国旅行社，能在台湾设立办事处，办理签证等业务；台湾当时响应表示，与其设置旅行社，不如互设办事处。

此后，海协会副会长王在希及陈云林又曾先后提及类似主张，足见这项议题，两岸之间都有高度意愿，但机构层级如何定位？经办的业务如何规范？仍然存有歧见。

举例来说，马英九表态“可考虑双方某些项目上互设机构”之后，“陆委会”随即强调，可朝向“综合性办事机构”方式进行；大陆方面认为，两岸互设机构，不妨先从民间机构，例如中国旅行社着手，充实其职能之后，再视情况提升到两会层次。换言之，台湾对于两会互设办事处，似乎倾向一步到位；大陆方面则希望循序渐进，先从民间机构开始，再进一步提升到两会层级。

依《台湾地区与大陆地区人民关系条例》第六条规定:“为处理台湾地区与大陆人民往来事务，‘行政院’得依对等原则，许可大陆之法人、团体或其它机构，在台湾地区设立分支机构。”准此规定，对于两岸互设机构，台湾就有法源依据。

事实上，去年六月，第一次“陈江会”签署的《大陆居民赴台湾旅游协议及包机会谈纪要》，双方同意针对航空公司和旅行社，互设旅游及办事机构；去年十一月，第二次陈江会签署的《海峡两岸海运协议》，亦载明两岸互设办事机构及营业性机构。说明两岸互设机构业已达成协议，而且在项目上已经有进展。

最近一年来，两岸两会已达成九项协议一项共识，但随着双方往来日益频繁，涉及权益的议题越来越多，许多技术面与执行层面的问题，需要两会及时沟通；经贸交易也越来越密切，需要有官方授权的机构，及时处理突发事件。因此，互设办事处的迫切性和必要性，也就越来越高。

对台湾而言，两岸互设办事机构，可以保障台胞在大陆境内旅游、经商及移居权益，岛内民众应当乐观其成。预料未来可能先从海运业、金融业、旅行业、空运业等行业先行办理；另外，新闻媒体也可能列为优先项目。

至于海协、海基两会互设办事处的时间、地点以及功能，由于牵涉甚广，必须经由两会协商，恐怕不是那么快就可以做到。尽管如此，两岸既然已有共识，只要开诚布公，存异求同，必然能够水到渠成，而两会若能互设办事处，意味双方所期待的签署和平协议，无疑又向前迈进了一大步。