死里逃生 1948年4月至10月任第二编练司令部司令。1948年9月初，国民党军队取消整编军番号，恢复原来的军师番号。此月，国防部授予胡琏陆军中将衔。胡琏的整编第十八军番号撤销后，所属的整编第十一师、整编 第三师和整编第十师都并入新组建的第十二兵团建制。国民党最高军事当局发表由黄维任兵团司令、胡琏任副司令。胡对此大为不满。但是，黄维是黄埔军校一期毕 业生，在十八军曾是胡琏的上级，声望比他还高，胡不得不表面恭顺，背后则满腹牢骚，不安于位。10月底，胡以父亲病重和医治牙病为由，请假离开部队跑到武 汉去了。

11月初，淮海战役揭开序幕。蒋介石命令黄维第十二兵团迅速开赴徐海淮蚌地区作战。第十二兵团11月8日由驻马店出发向安徽前进，18日到达蒙城的涡河、北淝河一带，即遭到中原野战军的进攻。25日，被中原野战军七个纵队包围在宿县西南双堆集地区。

第十二兵团被包围后，蒋介石发现胡琏不在前线，立即电召胡到南京面谈，问胡有什么办法能导致该兵团转为有利态势。胡认为这次战役是国共两党的大决战，即向 蒋表示愿意飞赴双堆集；协助黄维鼓舞士气，调整态势。蒋极为嘉许，并指示第十二兵团:“要固守下去，苦斗必生。”然后，蒋命令空军用小飞机把胡琏于12月 1日送到双堆集前方。胡向黄维和军师长传达了蒋的指示后，马上到各军师阵地视察，并将兵力作了局部调整。

几天之后，中原野战军的攻势更加猛烈。第十二兵团粮弹匮乏，南京空降飞机有减无增，局势越来越严重。黄维决定派胡琏去南京，一则向蒋介石报告险情，催运补 给，敦促救兵请示对策；二则要胡住在南京，以免和大家同归于尽。如果第十二兵团被歼，望胡能为大家处理善后。7日，胡琏飞南京向蒋介石报告双堆集情况。 8日晚，蒋介石邀宋希濂、胡琏，蒋经国共进晚餐，并放映电影《文天祥》。蒋对宋、胡说:“这个片子很好。”暗示宋、胡为其政权“效忠”。9日，胡琏再次飞 双堆集，向黄维等传达了蒋介石准许在危急时可以突围的指示。

12日，中原、华东野战军对第十二兵团发起总攻。15日，黄维突围的命令下达后，所部争先恐后乱成一团，结果除少数漏网者外，悉数被歼。胡琏因害怕当俘虏，在突围前向医务人员要了大量安眠药，准备在不能脱身时，服药自杀。胡后来乘战车冲出了重围，遇到第十八军未被包围的骑兵。不久，他跑到了南京。

最后一战 1949年2月，胡琏被南京国防部任命为第二编练司令部司令，负责收集从长江以北溃败逃至江南的官兵，并补充新兵。第二编练司令部设在江西南城，得到当时的省主席方天的许多帮助。不久，成立重建和督练第十八军及第十军。由高魁元、刘廉一分别任军长。是年4月，解放军渡江战役开始后，代总统李宗仁要胡琏率部 进驻大庾岭，胡对李的命令阳奉阴违，按兵不动，暗中却接受蒋介石的遥控指挥。5月中旬，南城解放。第二编练司令部改编为第十二兵团，胡琏任司令。

9月初， 胡兵团撤往广东潮汕地区，旋从海上逃往金门。10月25日，胡琏第十二兵团与李良荣第二十二兵团，在金门西北角的古宁头村，阻挠人民解放军登陆金门。这年 冬，胡琏被委任为福建省主席兼第十二兵团司令。1950年初，第十二兵团改为金门防卫军，胡琏为金门防卫军司令兼福建省主席及福建人民反共救国军总指挥。

1951年，胡琏在金门成立“福建省游击队”，后改名为“福建省反共救国军”，他任总指挥。胡曾派遣小股特务潜入福建省，妄想进入戴云山区进行反共游击活动。但不到一个星期，祖国大陆的军民就将这些特务一网打尽。

晚年岁月 1952年10月，胡琏加授陆军上将衔。同时，被选为台湾国民党“第七届中央委员”；此后，他连任第八、九、十、十一届中央委员。

1954年6月，胡琏奉凋回台北任第一野战军团司令。1957年又奉调去金门，再次出任金门防卫司令，1957年7月升任二级陆军上将。1958年8月23日，福建前线人民解放军炮轰金门，次日，胡令所部向大磴岛进行炮击。金门炮战持续了四十六天，9月任金门防卫司令部司令兼金门战地政务委员会主任。

1958年冬，金门防卫司令由刘安棋接任。胡琏擢升为陆军总司令部副总司令。1961年12月入国防研究院受训。1964年，胡琏出任“驻南越大使馆大使”，在职八年。1972年胡琏被免职回台北，任“总统府”战略顾问，并晋升 为一级陆军上将。他晚年爱好文学和历史，研读典籍，喜读古书，1974年附读台湾大学历史研究所，研究宋史和现代史。著《古宁头作战经过》、《泛述古宁头之战》、《金门忆旧》和《越南见闻》等书。1977年6月22 日，胡琏因患心脏病在台北逝世。