长期以来，台湾财政状况不佳，税基萎缩，赋税收入年增长率从1992年19.7%一路下滑到2001年的-6.7％。同时，各级公库和“国库”支出增长很快，在支出结构中，军备开支占了财政预算的很大比重，如1996年的财政预算中，“国防支出”(未含外购军备的特期预算)占了22.1％；若再把行政开支计入，整个财政开支中非生产性开支的比重很大。财政状况持续恶化，至2002年，台当局总负债已接近4兆新台币，债务余额占GDP比重超过30％。

台湾经济发展还受岛内政争激烈和两岸关系不稳定因素的影响。近几年来，台湾政党之争异常激烈和频繁，大大影响了有关政策与法规的制定和执行，也成为行政效率不高的原因之一；再加上“黑金政治”猖獗，使许多重大项目的工程进度和质量受到负面影响。同时，由于台湾当局推行分裂政策，造成两岸关系的不稳定，影响了台湾民间资本和外国资本在台湾的投资意愿。

综上所述，台湾经济面临的主要问题均是政治、经济深层次的结构性问题。虽然台湾当局采取了某些相应措施，其中某些措施不乏助益，但难以从根本上解决问题。