12日晚上，教授生前的学生纷纷在反对派的博客上发表悼念文章和评论。

据伊朗媒体报道，事件发生后几小时，保皇主义组织坦多尔(Tandor)在其网站上传了一份声明，声称对此次袭击负责。但数小时后，许多独立新闻机构发表了该组织的反驳声明，否认与此事有关，并谴责伊朗情报部以该组织名义建立了影子网站。该网站的真实性及上述言论无法甄别。

伊朗裔以色列分析家梅尔－贾维丹法说，总统内贾德和伊朗政权“最不可能”暗杀穆罕默迪：“那样的话，会让其他参与核计划项目的人感到恐惧。如果他们要想除掉他，可以在街上将其带走，随之一切都会归于历史。”

恐吓民众的手段

英国《金融时报》13日报道说，穆罕默迪遇刺一事颇有神秘感，他既是支持现政权的核科学家，同时又是反对派的支持者。伊朗改革派网站上的观点暗示，他支持反政府的立场让其丧命。穆萨维的官方网站将教授遇害与政府加强镇压批评人士的声音联系在一起。该网站上写道：“穆萨维先生的侄子去年12月27日被暗杀后，现在又轮到忠诚的德黑兰大学教授了。”将此暗杀视为伊朗强硬派恐吓民众的一种阴谋。反对总统内贾德的一些新闻网站认为，他的死与核武器项目无涉，而是因为他倾向于改革派。《金融时报》的报道还称，与革命卫队关系密切的半官方的法尔斯通讯社称，支持伊朗王权的“伊朗王国协会”也宣布对此袭击负责。由于被指控选举后煽动闹事，该组织的十多名成员现正在监狱关押。

美国《洛杉矶时报》13日称，伊朗强硬派政府指责美国、以色列和其他西方势力与暗杀有关，但改革派网站和教授的相识者却指控说这是强硬派下的黑手，目的是在校园制造恐慌。大学校园已经成为反政府活动的温床。这两种对立的观点，很可能加剧伊朗不稳定的政治气氛。

阿里－穆罕默迪的一个学生在伊朗博客上写道，他要求学生走上街头从事反政府的抗议活动，甚至坐小型公共汽车去参加示威活动。

不过，一名伊朗政府官员告诉伊朗学通社说，流亡的反政府武装组织“人民圣战者组织”此前曾有类似的谋杀行动，所以这种可能性也不能排除。

而德黑兰大学科学院院长接受法新社记者采访时说：“穆罕默迪是大学的全职教授，没有任何政治职务。”

美国务院反驳伊朗指控

美国白宫发言人比尔·伯顿12日说，伊朗媒体关于美国与一名伊朗核物理学家遇害有关的报道“荒谬”。根据白宫公布的消息，伯顿是在当天陪同总统奥巴马前往特拉华州参加副总统拜登之母葬礼途中，作出这番表示的，但他拒绝就此发表更多评论，他说不愿在事实尚不清楚时作判断。

以色列官员也拒绝就此作出评论。

暗杀事件发生前，伊朗已有一名任职于该国原子能组织的学者失踪。去年6月，这名学者在前往沙特阿拉伯麦加朝觐时一去不返。上月伊朗外交部指责沙特阿拉伯协助美国绑架了这名学者，称他现正被美国拘押。