“海峡交流基金会”于1990年11月21日成立，1991年3月9日举行开幕式，正式挂牌运行。该会分设由43人组成的董事会和由6人组成的监事会；“总统府资政”孙运璇为名誉董事长；国民党中常委、台湾工商协进会会长辜振甫任董事长；国民党中常委、台湾工业总会理事长许胜发和台湾红十字会秘书长，“国防部”法律顾问陈长文为副董事长兼秘书长，该会内设秘书处，文化服务处、经贸服务处、旅行服务处及综合服务处等6个业务单位，主要功能是接受“陆委会”委托，办理两岸交流所衍生的各项事务。