陈哲男涉嫌在任内教唆会计高慎慎炒作股票，高达159起“非法”股票交易案。而梁柏熏的贿款有可能也是炒股资金的一部分；而陈哲男的炒股案，与吴淑珍、马永成的炒股案，及秃鹰案、内线交易等有无关联，是否属于共犯结构，应追根究底。

2005年11月11日，邱毅爆料指出，陈哲男在4年“副秘书长”任内，指派“总统府”会计人员高慎慎5个户头供买卖股票等之用，利用人头户买卖股票，5个秘密账户的金额从上千万元“成长”到近亿元，期间赚多赔少。

根据调查证实，陈哲男在任内，的确以高慎慎的名义在银行开立账户，并且交代高慎慎在两天内交易180张的台湾兴柜股票，而在陈哲男的申报资料中，有台湾长兴化学、长荣航空等一千多万的各档股票，就是没有兴柜股票，明显“违法”。

而无党籍“立委”邱毅甚至还指控陈哲男股票获利惊人，怀疑陈哲男涉及内线交易，更质疑其与陈水扁夫人吴淑珍有着非常密切的联系，因此检方调查的重点，就是要查清陈哲男买卖股票的时间以及过程，是否涉嫌“违法”。

2006年1月25日，台北地检署首次对陈哲男进行约谈。