8月31日，因列宁遇刺，斯维尔德洛夫秘密紧急将托洛茨基召回莫斯科，商议国事。9月2日，托洛茨基在全俄中央执行委员会会议上讲话。他称列宁的遇刺是又一条战线——“弗拉基米尔·伊里奇胸廓上的战线”，“克里姆林宫的战线”。他说，“目前这条战线是最令人不安的。”在谈到喀山的情况时，他说已经有了以莫斯科和彼得格勒工人为骨干的严格纪律的、坚定的部队，这些部队与当地居民有了密切的接触，“使伏尔加河农民的情绪有了重大的转变”，“我们的部队在壮大，精神上和数量上都在增强”，因此，“胜利就在前面”。在全国的其他战线，也“有了多得多的胜利的机遇”。

托洛茨基指出，战线的情况已经发生了改变，因此为旧战线而成立的军事机构必须随之加以改变。他提出将适应旧战线的最高军事委员会和原本只为东方战线而建立的革命军事委员会合并。理由是，目前这场帝国主义强加的战争将不是在两周、两月内就可以结束的，谁也不清楚战争将会以怎样的方式进行下去，苏维埃共和国将不得不以怎样的措施来保卫自己。他认为，目前国家无论在军事领域还是在资源方面，都是消耗殆尽和贫乏的。他说：在这种情况下，“我们必须将苏维埃共和国变成一个军营，而我们所有的钱财，所有的力量，国家所有的财产，公民们的和公民各自的财产都应该径直用于保卫苏维埃共和国。”他要求实行动员，动员经济，动员人力，动员人们的精神。因此，托洛茨基呼吁：“应该由一个领导机构，由革命军事委员会，和一个总司令来领导苏维埃共和国的武装力量和财力。”

托洛茨基还警告说，未来的两个月是极其困难和艰险的，但这两个月过去之后，就是胜利。他说：“我们相信，弗拉基米尔·伊里奇胸廓上的斗争将以生命的胜利而告终”，“在为数不多的几周内，在工人阶级的领袖重新站立起来的时间里，我们定将在其它战线上取的胜利。”托洛茨基的这番话稳定和团结了全俄中央执行委员会的领导力量，对作战中的军队和处于艰险抗争中的民众相信自己的力量、相信苏维埃共和国的未来产生了重大的积极影响。这次全俄中央执行委员会通过了将权力集中于革命军事委员会的决定。

会后，托洛茨基返回斯维亚日斯克的指挥列车，参加了收复喀山的战斗。几经凶险和波折，喀山终于在9月10日被红军攻克。对于喀山之战，托洛茨基感慨地说：“我们亲身感受到战争的波澜起伏和出人意料。小战争却是大学校。”而这时，列宁康复，终于重新站立起来，他对喀山的收复极为高兴，11日给托洛茨基发去如下电报：“喀山，托洛茨基。我热烈祝贺红军的辉煌胜利。愿这一胜利成为工人和革命农民的联盟彻底打垮资产阶级、粉碎剥削者的一切反抗并使世界社会主义取得胜利的保证。世界工人革命万岁!”9月12日，红军第一集团军攻克列宁的故乡辛比尔斯克。红军战士给列宁发来电报：“亲爱的弗拉基米尔·伊里奇！收复您的故乡，这是为您所受的一处伤而对敌人的回答，为了您受的另一处伤，我们要收复萨马拉！”列宁回电说：“我的故乡辛比尔斯克的收复，是包扎我的伤口的一条最有效最理想的绷带。我顿时觉得精神振奋，力量骤增。我祝贺红军战士的胜利，并代表全体劳动者对他们做出的一切牺牲表示感谢。”

喀山之战是个重大的转折点。它不仅击退了捷克斯洛伐克兵团的进攻，而且扭转了伏尔加河一线的战局，消除了苏维埃共和国面临覆灭的威胁。同时，胜利使民众的情绪发生急转，人们开始相信为了生存和自由的生活，必须进行抗击帝国主义的战争，曾经蔓延的厌战情绪得到有效的消除。而更为重要的是，喀山之战使苏维埃共和国从此有了真正的红军，有了能保卫自己政权的武装力量。托洛茨基的建军路线和实践也在喀山之战的战火中经受住了艰难的考验。自喀山之战后，苏维埃共和国重新挺立，新组建的红军赫然屹立。对于国家，对于红军，喀山之战，这都是凤凰涅槃。

喀山之战后，苏维埃俄国的国内战争远没有结束，各条战线上还不断传来告急的警报。列宁曾为此指令托洛茨基到危急地点去就地指挥战事和处置红军事务。托洛茨基的专列也就在整个国内战争期间巡行了俄国的一系列战线，而在这种巡行中，托洛茨基也就将红军的建军事务陆续扩展下去。