二战中的日本航母遭到潜艇打击的损失程度更大，几乎一多半被击沉的航母都是被潜艇击沉的。1944年的玛丽亚纳海战中，日本航母编队极为重视防空，并试图利用舰载机航程大于美军的优势，使美国航母无法对其进行打击，但最终却遭到了潜艇的沉重打击（两艘最大的航母被潜艇击沉）。上图为被美国潜艇击沉的“翔鹤”号航母，下图为被美国潜艇击沉的“大凤”号航母。