在当地政府和专家的推动下，玛曲湿地的保护引起了国家层面的重视。《甘南黄河上游重要水源补给生态功能区保护与建设规划》被列入国家“十一五”规划，于2007年12月4日，获得国务院正式批复实施，项目总投资44.51亿元。

据介绍，该项目分近、远期实施，2006年—2010年，以草原、湿地为重点，尽快遏制生态环境急剧恶化趋势；2011年 —2020年，以水源涵养和补给区为重点，全面恢复和增强黄河水源补给综合功能，走经济发展与生态保护良性循环的路子。

与此同时，社会各界保护甘南湿地的活动也此起彼伏。2007年3月，全国“两会”期间，人大代表、政协委员和专家达成共识，形成了甘肃省黄河流域水土保持生态建设的提案。

而在甘南，当地政府一方面实施“农牧互补”战略，通过专业化、规模化养殖减少草场载畜量。如玛曲县曼尔玛乡乔科湿地核心区的82户牧民已搬迁到萨合牧民新村。

另一方面通过发展畜产品加工业、旅游生态产业及第三产业，合理流转从事畜牧业者。如碌曲尕秀村牧民扎西草将自家牧场、牛羊流转承包给村上的养殖大户，自己则专门搞缝纫。

通过实施退牧还草工程，甘南1800多万亩草场得以围栏。在玛曲县尼玛镇，黄河岸边的沙丘上布满了密密麻麻的草方格，草方格里种上了星星点点的沙棘、柴胡、燕麦草。

近年，甘肃省政府对甘南黄河重要水源补给生态功能区的生态加大了治理力度，申请设立了多个自然保护区，并投入数亿元资金，实施了一系列生态保护工程，缓解了人为因素对生态的破坏，局部地区生态环境恶化的趋势有所缓解。

据了解，甘肃省“十一五”期间推动10项战略性重大工程的建设，总投资2500亿元。其中就有甘南黄河重要水源供给区生态保护与建设工程。

2009年3月，《甘南黄河重要水源补给生态功能区生态保护与建设规划湿地保护与恢复》等12个项目调研报告通过甘肃省发改委审查并批复。

《中国经济周刊》获悉:甘肃省发改委对湿地保护与恢复工程等12项目，归并后按10个项目分别进行了批复。

当地一位官员告诉《中国经济周刊》:“湿地保护与恢复工程等10个子项目的批复，为争取新增项目得到国家的支持奠定了基础，在国家拉动内需和支持藏区经济发展的优惠政策下，有望得到国家的支持和投资，先期启动安排一批成熟的项目。”

甘南州州长毛生武表示:这些项目的实施，为遏制甘南生态恶化趋势，起到重大作用，同时有利于进一步促进农牧民增收和生产生活水平的提高，推动社会经济结构转型，妥善解决生态移民问题。

在甘南碌曲县召开的若尔盖高原湿地保护委员会2009年年会上通过的《若尔盖高原湿地保护与可持续利用战略计划》，是有关各方联合出台的关于若尔盖高原湿地保护的第一张“路线图”。该计划对保护区范围内的甘南黄河重要水源补给区的生态保护与建设提出了具体要求。

可以预期的是，随着甘南黄河重要水源补给生态功能区生态保护与建设，一个生态环境良性循环、环境优美的新甘南将呈现在世人面前。