全世界很快知道了日本军国主义者在中国对美国战舰的空袭。然而，日本有关部门辩解说，这是一次误炸，日机飞行员们由于当时天气“能见度差”，把“班乃岛”号的国籍“看错”了。

日本方面还声称，当时，日本空军有情报说，国民党军队正从南京撤离，因此日本空军才决定实施空袭。日本向美国方面进行了道歉，并决定赔偿美舰损失。1938年4月22日，日本向美方赔偿221万美元。其中，受伤的赫夫曼获得了1200美元的赔偿。为了安抚美国，日本还假惺惺地把一名海军海将补(少将)撤职查办。

然而，赫夫曼至今仍认为，这不是“误炸”，而是日本故意而为，“他们知道我们是谁”。“班乃岛”号战舰为了防止日机误炸，曾在一些地方悬挂几面很大很显眼的国旗，那天天气很好，空中日机飞行员完全可以看得很清楚。

美国炮艇被击沉后，炮艇的军事作用成为美国国会和军方争论的一大焦点。美国海军一些官员认为，用于江河作战的小炮艇没有多大军事价值，海军没必要继续研制新的炮艇。二战开始后，美国海军逐步淘汰炮艇，发展航母之类的大型战舰。