中国团队发布开源RNA序列基础模型 【中国科研团队发布开源RNA序列基础模型】据“中国科学技术大学”微信公众号11月5日披露,近日,中国科学技术大学医学影像智能与机器人(MIRACLE)实验室周少华教授、熊鹏特任研究员团队发布开源RNA序列基础模型structRFM。
该模型将结构知识融入大规模序列学习,提高了RNA结构预测与功能推断一系列下游任务性能,有望助力人工智能(AI)驱动的科学研究、生物学机制理解和药物发现。
11月5日凌晨,该成果发表于《自然》(Nature)。这是2026年至今中国科大以第一署名及通讯单位在Nature、Science、Cell三大顶刊发表的第16篇成果。
RNA广泛参与蛋白质合成、基因表达调控和RNA剪接等过程,其功能与序列、折叠结构密切相关。RNA通过碱基配对形成二级结构并折叠为三维构象,影响生物学活性及分子互作。理解序列、结构与功能联系,是揭示RNA机制和支撑药物发现的重要基础。
随着测序技术发展,海量RNA序列数据为借鉴自然语言处理预训练方法提供了条件。RNA基础模型可从数据中学习序列规律,提取通用特征。
此次研究中,团队构建约2100万条经计算注释的序列—二级结构配对数据,并设计算法同时预训练学习序列上下文与结构依赖。预训练后的structRFM仅需输入序列,即可提取序列级、核苷酸级和核苷酸对级特征,用于多种结构与功能推断任务,多项任务达到国际前沿水平。目前,实验室已开放完整配对数据、模型权重和源代码,为结果复现和模型开发提供可复用资源。

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