马英九28日表示，代表台湾和大陆谈的，只有“陆委会”跟海基会。据台湾“中央社”报道，马英九28日下午谈到连战往访大陆，是否通过国共平台影响政府时表示，政府体制里面，规定地非常清楚，在“行政院”主管大陆政策就是“陆委会”，海峡交流基金会接受“陆委会”委托办理有关两岸事务。

马英九说，“陆委会”、海基会是政府正式的单位，至于其它的，没有经过政府授权的，要进行各式各样的活动，只要是在法律范围内是许可的，都可以；但是代表政府的，只有“陆委会”跟海基会，这一点应该是非常清楚的。

对于前台联党“立委”赖幸媛将出任“陆委会”主委，内定海基会董事长江丙坤28日说，推动两岸事务需要各部会协调配合，他相信未来海基会与“陆委会”沟通会很顺畅，配合得很好。