6月13日，“行政院长”俞国华秉承蒋经国旨意称：六一二街头“动乱”将“依法”惩处，追究刑事责任。他指示“内政部”、“司法部”尽速处理此一事件，并提出4条处理原则。6月17日，“法务部长”施启扬也表示：当局将“依法”公平处理六一二事件。施还宣称：台北地检处已对六一二事件的首谋分子谢长廷、洪奇昌、江盖世、许承东发出传票，于6月20日到庭应讯。这几人的罪名是“涉有妨害公共秩序等罪嫌”。1987年7月15日《中央日报》。

针对蒋经国与当局领导人的严厉口吻与措施，党外人士立刻反击。6月15日，民进党籍“立委”尤清、黄煌雄、康宁祥、朱高正、许荣淑等在“立法院”审议“国安法”时提出抗议，会场发生混乱，费希平等人退席。18日，民进党党籍“国大代表”声称将于20日强行晋见蒋经国。蒋经国见状决定加快“国安法”的审定工作，及早解除“戒严”，以缓和同党外势力的冲突。7月8日，蒋经国在国民党中常会上作报告时，态度较为和缓地说：

“现在已经决定‘解严’，解除‘戒严令’是我们‘国家’的一件大事”，“是早已决定的大方向”，“在这大转变的时代，我们不必去计较那些小地方，要从大处和远处看。诚然目前仍有许多困难，但我们要克服这些困难”。《蒋“总统”经国先生言论著述汇编》第15辑第364页

与此同时，“立法院”根据蒋经国的一系列指示，通过了“动员戡乱时期国家安全法(草案)”。