苏东坡照样上书反对，一篇《议学校贡举状》获得了皇帝极高的评价，亲蒙神宗召见，皇帝勉励苏东坡:“尽陈得失，无有所隐。”

但是没有用，朝中有关新法的斗争大局已定，所有反对新法的高官大臣都已近乎全部去职，不过王安石有一点还不错:轻易不开刀杀人。

苏东坡明白这险恶朝局，一切势态都呈现不利局面，即便自己不遭大祸，但遭到罢黜是必然无疑的。

不过苏东坡还是上书用孟子的教导提醒皇帝:一是“君权民授”，一是“为政当容清议”。他警告皇帝:君之为君，非由神权而得，乃得自人民之拥护，为帝王者不可不知。第二点苏东坡替孟子解释:为人君者若不容许自由表示意见，焉能得到人的支持？一个好政权能够得以保持，在于不同的政见能够合理地发挥功用。苏东坡在对比了古今历代政权施政的优劣后告诉皇帝:万不可以威权压服百姓而使之服从。这是针对谣传朝廷欲恢复肉刑之说，而结果酷刑最终也未曾恢复，这当归功于苏东坡。

皇帝欣赏也没有用，苏东坡所有的上书几乎都石沉大海，新法照样实施不误。针对皇帝临时下的一个严禁强销青苗贷款的诏书，苏东坡继续上书。苏东坡引用孟子的话说:这如同一个偷鸡贼想改过向善，于是决定每月只偷一只鸡。

事情就是这么奇怪，苏东坡不但没有遭到罢免，反而被委任了一个可以参政的兼职:权开封府推官。

在开封府推官任期内，苏东坡出了一道乡试考题《论独断》（全题是:晋武平吴，以独断而克；齐小白专任管仲而霸；燕哙专任子之而败。事同而功异，何也？），此考题将矛头直指宰相专权！这下终于激怒了王安石。

报复比苏东坡自己上书前所预料的还要厉害——苏东坡被立即立案调查。

不过立案的理由实在让人难以心服。王安石的亲戚兼随员谢景温，挟法诬告，说苏氏兄弟运父灵柩乘船回四川原籍途中，曾滥用官家的卫兵，并购买家具瓷器，并可能偷运私盐从中牟利。

以经济问题作为手段，达到政治斗争的目的，这等高招，宋代的官员掌握得极为娴熟。