贝·布托遇刺身亡后，谁是幕后凶手成了国际社会最关注的焦点问题。对此，国际问题观察家与分析家认，对贝·布托下黑手的可能以五股可能的势力。

嫌疑1：塔利班和“基地”“混合暗杀小组”

事实上，在贝·布托此次回国遇袭之前，她就曾接到一份绝密情报——4支自杀小分队已潜入卡拉奇，准备对她下手。这4支小分队分别是由巴基斯坦的塔利班分子、阿富汗塔利班分子、“基地”组织派出的。回国前，贝·布托曾将其中3个小分队头目的名字及电话号码通报给了穆沙拉夫。

10月18日袭击事件发生后，巴调查人员发现，袭击者用的是C4烈性炸药，与某个组织2006年3月袭击美国驻卡拉奇领事馆及试图谋杀穆沙拉夫所用的炸药完全相同。迄今为止，巴情报机构仍不知该组织的庐山真面目。一名调查官认为，“这些人与‘基地’组织或塔利班有关联，是一群不满女人当权的极端分子。”事实上，“基地”组织发言人和二号人物扎瓦赫里先后证实，就是他们要“消灭”亲美国的贝·布托。

嫌疑2：卡拉奇当地势力ＭＱＭ

ＭＱＭ又称“印度移民运动”，主要势力在卡拉奇，但其领导人现居英国。贝·布托在爆炸后的新闻发布会上提到的暗杀分队最后一支，即“来自卡拉奇当地”。一名退役将军在电视台发表言论称，惨案可能由ＭＱＭ领导人阿尔塔夫·侯塞因导演，因他一再表达出对布托完全听命于美国人的憎恨。事实上，该组织的一名当地头领在10月18日的袭击事件发生后公然宣称：“我们将在肉体上消灭贝·布托。”

嫌疑3：情报局长伊贾兹·沙

巴人民党领导人指责巴情报局长伊贾兹·沙（退役准将）应为爆炸负责。可靠消息说，贝·布托曾在给穆沙拉夫总统的信中声称伊贾兹及旁遮普省首席部长乔杜里·伊拉希都意图取其性命。

伊贾兹将于明年２月结束其职务任期，据说贝·布托在爆炸案后要求政府将其罢免，但政府则要求提供证据。

嫌疑4：部落武装分子迈赫苏德

部落武装分子首脑之一巴伊图拉·迈赫苏德也是被怀疑对象之一。他的手下曾于过去的数月之内绑架了数百名巴基斯坦士兵，后在部落族长会议后释放了一部分，目前他还扣押着约２６０名今年８月３０日绑架的巴安全人员。

但爆炸案发生后，一名自称是迈赫苏德助手人从给《新闻》报记者打电话，说其代表迈赫苏德发言，否认参与这次爆炸事件。但他也威胁说，如果最终贝·布托为取悦美国及其盟友而采取反塔利班政策的话，将面临严重后果。