马当局处理台军重要军事投资案方式出现微妙变化，对于十亿元以上建案，由“国防部”走行政流程提报“行政院”。但“国防部”日前却接获“行政院”指示，要求“国防部”先向“总统府”上大签并获正式批示同意后，再提给“行政院”审查。

据台《联合报》报道，“国防部”军事发言人池玉兰证实，今年“国防部”首度上大签给马英九，由他亲自批示同意“国防部”明年度十亿元以上包括翔展案在内的重大军事投资建案，大签同意后，“行政院”才接受“国防部”将建案送交审查。她强调，今年这个作法确实与往年不同，只是为了让整个程序更为完备。

“行政院”发言人史亚平表示，马英九是三军统帅，军事建案都应先经他许可，再循例编入预算。“行政院”在拉法叶案后，为强化重大军事采购计划审议，特别规定自2000年度起，新台币十亿元以上的重大军购计划，纳入现行审议程序后，呈报“行政院”核定。

军方内部盛传，今年上大签的作法事出有因，原本“国防部”依往例将案子送进“行政院”，却获得需要马英九更明确指示的讯息，为此二周前“国防部”由业管单位拟好大签，专人送进“总统府”让马批示。

知情人士称，多出来这个程序更是近十年来首例，过去在民进党当局，“行政院”对于这类案子通常会直接处理，像是经费达五百多亿元的阿帕契攻击直升机“天鹰案”、七百多亿元的黑鹰通用直升机“天鸢案”，都是由“国防部”呈“行政院”即可审核，从没有要求“总统”出面背书的纪录。