在马英九兼任党主席的情况下，乡镇市长的政治前途，几乎全掌握在马一人手中。

台海网7月4日讯 台湾“行政院会”前天不仅核定4个“直辖市”改制案，“内政部长”廖了以透露，明年新选出的“直辖市长”将面临乡镇市区整并问题，全台现有368个乡镇市区，未来将整并为100至150个。马英九的大动作，备受外界瞩目，有政坛人士形容，如果扁以二次金改生杀大权，换取企业界效忠，马就是藉着行政区划整并，掐住地方派系咽喉。

据香港中评社报道，一位国民党资深“立委”分析，12年前马英九担任“法务部长”时，就是因为卖力查察县市长、乡镇市长和乡镇市民代表选举贿选，得罪了地方派系，向当时的“总统”李登辉告状，最后才转任“政务委员”。

因此，马对于盘根错结的地方派系，以及和黑金势力纠葛在一起的生态，可以说是深恶痛绝。包括国民党前“立委”许舒博和101大楼董座擦肩而过，以及“立委”傅昆萁的花莲县长美梦可能无法如愿，就是马英九展现不愿意向地方势力妥协的决心，坚持不被派系牵着鼻子走的代表作。

政坛人士认为，目前台湾300多个乡镇市长，绝大多数都是国民党籍，虽然未来行政区划整并，乡镇市一口气少了三分之二，不过日后乡镇市如何整并，完全掌握在行政部门手中。而乡镇市长提名和辅选动员，又由党务系统全盘掌控，在马英九兼任党主席的情况下，乡镇市长的政治前途，几乎全掌握在马一人手中。

更何况，台湾地方派系政治人物的养成，除了农田水利会与信用合作社系统之外，最主要的就是从乡镇市长开始。未来只要马英九好好利用党务系统，不仅可以收编地方派系，更可以发挥如臂使指的效果，在“大选”发挥相加相乘效果。