国民党立委吴敦义23号透露，特侦组搜索陈水扁住宅当天，检察总长陈聪明据说曾造访扁家密友、新光医院副院长黄芳彦住处。他要求法务部长王清峰立即调查，如果真有其事必须惩处，如果没有，也必须还陈聪明清白，而王清峰承诺马上办。

吴敦义指出，这项消息是有人告诉他的，但他确实不了解是真是假。黄芳彦随後作出回应，坚决否认有这件事。陈聪明和最高检察署23号晚间表示，吴敦义说法纯属子虚乌有，绝无此事。吴敦义又对检方侦办扁案态度十分不以为然，一下子怕疲劳侦讯，一下子又怕病体无法应付侦讯，检方对扁家可说极尽体贴之能事，他要求法务部应该告诉检方，查案必须把腰杆挺直。王清峰回应表示，一定会做到，且非做不可。