王郁琦说，第二段主题“深耕和平思维，强化自卫实力”，和平协议必须由善意与互信一点一滴累积而成，短期内两岸间应从各面向展开并扩大交流与合作，包括经贸、文教、国际空间的营造等；让这些交流与合作化解双方敌意，形成良性循环，为和平扎下坚实基础。

马英九认为，台湾要强化自卫实力，“国防”预算要占国民生产毛额的百分之三，强化自卫实力是为了防止战争，而不是为了挑衅，“因为两岸人民同属中华民族，不能重演过去内战所造成的遗憾。”

王郁琦说，第三段主题是“从杀戮战场到和平广场”，马英九认为，若没有昨日金门苦难，就没有今日台湾繁荣，金门人民牺牲自由，台湾居民才能享受自由，“我们除了心存感恩外，更应努力让金门从20世纪的两岸杀戮战场，蜕变成21世纪台海的和平广场。”

马英九认为，“行政院”已责成经建会配合两岸新情势及小三通全面正常化，通盘检讨规划金门中长期经济建设，结合金门丰富的观光、人文、资源及产业基础，活化地方经济，至于金厦通水及兴建大桥的构想，也都可以讨论评估。