之后进行振动频率测量，测得歼6原型进气道外侧自振频率为250赫兹，歼6Ⅲ机进气道外侧自振频率为400赫兹。自振频率可能会由于结构不同导致数据不同，因此沈飞厂技术攻关组认为如果能够修改锥体以改善进气道负压，就可以不掉铆钉。后来又用60度各种锥体——大锥体、过度锥体、小锥体试验。结果在地面开车两小时后，进气道内铆钉掉了3个；开车6小时后，进气道的铆钉掉了一大片。

为了进一步解决进气道负压过大的问题，沈飞厂技术攻关组决定在在前机身唇口至1框之间的两侧开8个辅助进气门。开了辅助进气门后，进气道负压过高的问题立刻有所改善，经过36个小时的试验，只发现有4个铆钉翘边，没有铆钉掉下来。因为进气道负压和振动均比原型要低，经空中打炮试验没有影响，没有发生发动机停车，在12000米高空也没有发生发动机停车。这时可以认为歼6Ⅲ飞机在进气道唇口开8个辅助进气门，是克服掉铆钉最好的办法。于是沈飞厂对已生产的300多架歼6Ⅲ飞机都加了8个辅助进气门。

然而在后来歼6Ⅲ与歼6原型进行对比试飞时，发现了新的问题。当歼6Ⅲ作僚机时，跟不上担任长机的歼6原型。而且相比之下歼6Ⅲ的速度不但有所下降，着陆滑跑距离也延长了。此时改进的歼6Ⅲ“速度快、操纵灵活”等优点，已经基本丧失殆尽。

不过至少经过改进的歼6Ⅲ不再掉铆钉，随后沈飞厂通过其他小的修改排除了各种故障，此外还进行了翼尖挂导弹的试飞。这项返修工作从1971年持续到1973年。

1975年，根据中央军委关于整顿装备的会议决定，歼6Ⅲ再次返回沈飞厂返修，将飞机的液压系统改为原型，排除操纵过灵的问题。同时将减速伞舱移至机尾上部，并加挂导弹，然后交付部队使用。

011基地生产歼6Ⅲ

歼6Ⅲ歼击机之所以诞生的一个重要原因，是因为当时我国边境局势越来越紧张，空军需要适合大机群作战的、易于大量生产大量损耗的大规模决战用战斗机。在这一时期，我国的边境受到帝国主义的严重威胁，1964年8月17日、20日，毛泽东在中央书记处会议上两次指出，要准备帝国主义可能发动侵略战争。而歼6Ⅲ则是为了应对随时可能爆发的突发情况而准备的前线决战用战斗机。

然而另一方面，我国工厂都集中在大城市和沿海地区，不利于备战。因此1964年中央书记处会议决定，首先集中力量建设三线，在人力、物力、财力上给予保证。第一线能搬迁的项目要搬，明后年不能见效的项目一律缩小规模。于是，调整后的“三五”计划指导思想再度发生变化，三线建设的战略决策终于确立。在1965年9月至10月召开的中共中央北京工作会议上，同意“三五”计划的基本方针为：“以国防建设第一，加速‘三线’建设，逐步改变工业布局”。自此，经济建设的中心从解决吃穿转变为备战。